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针对实时服务的需求和大规模代谢网络的大计算量，构建了一个基于集群系统的多层体系结构的代谢网络仿真环境，主要采用Applet技术、系统生物学描述语言（SBML）、Servlet与Applet之间的通信技术、线程池技术和负载平衡机制来实现。基于这个仿真环境，结合已有的代谢网络仿真技术，提供了一个远程在线的代谢网络的仿真服务。该仿真环境不仅便于升级和维护，而且具有平台无关性、强大的计算性能和对重负荷的支持能力。