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目的:探索赖氨酸缺乏蛋白激酶1(Wnk1)基因单核苷酸多态性(SNP)与中国汉族人群缺血性卒中的关系。方法:收集2008年1月~2009年12月新疆5所医院294例汉族缺血性卒中患者(病例组)和同期外科系统住院治疗的其他无脑梗死疾病的汉族患者314例(对照组)进行病例对照研究。用标签SNP(tSNP)策略选择Wnk1基因10个SNP位点(rs3858703、rs11611246、rs7305065、rs1990021、rs34408667、rs12309274、rs1012729、rs956868、rs12828016、rs953361)。SNP基因分型检测采用多重SNaPshot平台。用t检验、卡方检验和logistic回归分析对数据进行统计分析,用Haploview软件进行连锁不平衡分析和单倍型分析。结果:病例组饮酒(37.1%)、高血压病(62.9%)、糖尿病(18.0%)、高脂血症(36.4%)患者比例均高于对照组(均P<0.01),而吸烟者比例在两组间差异无统计学意义(P>0.05)。所有位点基因分型缺失率均在1%以下。除rs34408667位点外,其余tSNP均通过Hardy-Weinberg平衡检验。Wnk1基因第四内含子rs11611246位点与汉族缺血性卒中相关。T等位基因在病例组中的分布频率低于对照组(30.3%与35.7%,P=0.046)。进行性别分层后发现,rs11611246 T等位基因是汉族男性缺血性卒中发病的保护因子。GT基因型及TT基因型在病例组男性中的分布频率分别为43.3%及7.2%,而在对照组男性中的分布频率分别为43.1%及15.2%(P=0.038)。加性遗传模型显示T等位基因携带者发生缺血性卒中的风险是对照组的0.702倍(95%CI:0.517~0.953,P=0.023)。调整年龄后差异仍然存在(P=0.022),进一步调整年龄、体质量指数、吸烟、饮酒、高血压、糖尿病、高脂血症等混杂因素后,差异仍然存在(P=0.008)。未发现Wnk1基因其余9个SNP位点与汉族人脑梗死相关。结论:Wnk1基因第四内含子rs11611246多态性影响中国人缺血性卒中的发生。rs11611246位点T等位基因可能是汉族男性发生缺血性卒中的保护因素。