【摘 要】
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为研究毛蕊花糖苷生物合成下游途径,本文采用基于单分子测序技术对地黄进行全长转录组测序.结果 得到26.61 Gb数据,96548条高质量一致序列,61262条非冗余转录本序列,共鉴定出3070个可变剪接,34013个SSR,4241个lncRNA,46412个完整CDS序列,56633个转录本注释NR、GO和KEGG等数据库,有326条转录本注释到毛蕊花糖苷合成途径中.实时荧光定量PCR结果揭示毛蕊花糖苷生物合成下游途径关键酶基因URT、CCCT和HCT在高毛蕊花糖苷含量的野生地黄中高表达,且均对MeJA
【机 构】
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河南师范大学生命科学学院,河南新乡453007
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为研究毛蕊花糖苷生物合成下游途径,本文采用基于单分子测序技术对地黄进行全长转录组测序.结果 得到26.61 Gb数据,96548条高质量一致序列,61262条非冗余转录本序列,共鉴定出3070个可变剪接,34013个SSR,4241个lncRNA,46412个完整CDS序列,56633个转录本注释NR、GO和KEGG等数据库,有326条转录本注释到毛蕊花糖苷合成途径中.实时荧光定量PCR结果揭示毛蕊花糖苷生物合成下游途径关键酶基因URT、CCCT和HCT在高毛蕊花糖苷含量的野生地黄中高表达,且均对MeJA诱导存在“V”型响应趋势.
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