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ISSR是一种基于微卫星序列发展起来的新的分子标记，具有简便、稳定、DNA多态性高等优点。ISSR标记呈孟德尔式遗传，大部分ISSR标记为显性标记。综合有关文献就ISSR的原理、操作及其在水产生物品种鉴定、亲缘关系分析、遗传多样性检测、遗传图谱构建和分子标记辅助育种等方面的应用和进展进行了简要的阐述。