【摘 要】
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目的:为早期筛查、获取有效诊治手段来提高肺腺癌(LUAD)患者的总体生存率,探索PIK3R1基因低甲基化指标对肺腺癌诊疗及预后判断的影响。方法:使用大型公共数据库:TCGA、GEO、GEPIA2、UALCAN、KaplanMeier Plotter、LinkedOmics和TIMER进行在线分析。在LUAD人群不同的临床特征亚组中构建单变量和多变量COX比例风险模型。结果:低表达的PIK3R1会导
【基金项目】
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国家自然科学基金青年项目(81302030);
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目的:为早期筛查、获取有效诊治手段来提高肺腺癌(LUAD)患者的总体生存率,探索PIK3R1基因低甲基化指标对肺腺癌诊疗及预后判断的影响。方法:使用大型公共数据库:TCGA、GEO、GEPIA2、UALCAN、KaplanMeier Plotter、LinkedOmics和TIMER进行在线分析。在LUAD人群不同的临床特征亚组中构建单变量和多变量COX比例风险模型。结果:低表达的PIK3R1会导致LUAD患者的总生存期(OS)、首次进展后生存期(FP)和疾病进展后生存期(PPS)较差。性别、肿瘤分期、吸烟史、T分型、N分型和PIK3R1低表达是LUAD发病的危险因素,低表达的PIK3R1是LUAD的潜在独立危险因素。DNA甲基化分析显示,探针ID(包括cg01239651、cg24797508、cg16664523和cg25008444)的PIK3R1启动子内CpGs的低甲基化通过DNA甲基转移酶(DNMT1)降低PIK3R1的表达。ROC曲线分析显示,PIK3R1的甲基化和表达在LUAD的准确诊断中具有高灵敏度和特异度。免疫分析研究表明,PIK3R1低甲基化和表达与免疫细胞(B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞)浸润有关。此外,共表达基因(PGR、C5orf41、SCN7A、RBMS3、FAT4、RASSF2、A2M、ITGA8、FLI1和RECK)通常与PIK3R1具有相似的功能。结论:PIK3R1的低甲基化及表达可视为肺腺癌的一种特异性诊断生物标志物和独立的预后因素,并可以预测免疫治疗的有效性。
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