【摘 要】
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选取法国高低脂2组7周龄肉鸡腹部脂肪的RNA測序转录组数据中的17 934个基因,采用差分稀疏调节网络(differential sparsE regulatory network,DISCERN)算法对相应数据进行分析
【机 构】
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东北农业大学动物科学技术学院,黑龙江哈尔滨150030;农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江哈尔滨150030;黑龙江省教育厅动物遗传育种与繁殖重点实验室,黑龙江哈尔滨150030
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选取法国高低脂2组7周龄肉鸡腹部脂肪的RNA測序转录组数据中的17 934个基因,采用差分稀疏调节网络(differential sparsE regulatory network,DISCERN)算法对相应数据进行分析,以期筛选出影响肉鸡腹部脂肪沉积的关键基因,并识别肉鸡不同基因表达数据之间网络差异关系,推断基因调控依赖网络的信息拓扑变化.结果显示,通过DISCERN算法发现HCN4、NPPC、UCN3等基因在17 934个基因得分排序中得分相对较高,推断NPPC、HCN4、UCN3等基因可能是影响肉鸡腹部脂肪沉积的关键基因.本试验采用DISCERN算法,剖析网络结构变化,通过对基因网络进行量化分析,对农业动物转录组测序数据分析方法进行了新的尝试和创新.
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