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优良推广品种的利用价值取决于其携带的优异基因，通过基因组差异研究可提供这些优异基因最基本的遗传信息，有助于加快其研究、利用。为此，在中国烟草总公司和贵州省局（公司）的资助下，由贵州省烟草科学研究院牵头，联合行业内外多个单位实施的烟草主要品种和核心种质资源基因组差异研究工作，对100年来中国和美国育成的具有明确系谱关系的主要栽培品种进行了基因组测序，围绕基因组结构变异揭示育种目标这一核心主题，取得了显著进展。