结肠癌淋巴结转移的风险基因及列线图预测模型的构建

来源 :肿瘤防治研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户：bbpooh123

【摘要】

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目的寻找结肠癌淋巴结转移的相关风险基因,并构建由基因组成的列线图(nomogram)预测模型。方法从TCGA和GEO数据库下载基因测序数据,利用差异分析和LASSO回归方法筛选基因。利

【作者】

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武杰李岚张惠博吴思怡宋启斌

【机构】

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武汉大学人民医院肿瘤中心

【出处】

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肿瘤防治研究

【发表日期】

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2020年12期

【关键词】

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结肠癌淋巴结转移列线图模型决策曲线分析 Colon cancerLymph nodes metastasisNomogram modelDecision

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81670123,81670144)

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目的寻找结肠癌淋巴结转移的相关风险基因,并构建由基因组成的列线图(nomogram)预测模型。方法从TCGA和GEO数据库下载基因测序数据,利用差异分析和LASSO回归方法筛选基因。利用赤池信息准则确定最优的nomogram模型,ROC曲线、校准曲线及拟合优度检验评估模型预测的准确性,决策曲线分析评估临床应用价值。结果通过筛选得到11个有效预测结肠癌淋巴结转移的基因。由年龄、病理T分期、TH、CDH4、PNMA6A、TNNC1、KIR2DL4、STUM、SFTA2构成的nomogram模型具有最小的AIC

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