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因特网上的Web服务器是生物学家的主要网络资源[1]，就目前的数学和计算机科学能力而言，不同的基因组序列项目产生的大量序列，仍是生物计算领域的主要挑战之一。如何从生物数据的海量中获取蛋白质序列最有价值的信息？首要条件是访问由几个生物计算中心如NCBI、EBI、EMBL、SIB和INFOBIOGEN研究开发的最新序列和结构数据库(例：EMBL、GenBank、Swiss-Prot、ProteinData Bank)。网络蛋白质序列分析(NetworkProtein Sequence Analysis，NPS