桃果肉近核色素copia-like反转录转座子序列分析及分子标记的建立

来源 :农业科学与技术:英文版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wangyu1221

【摘要】

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通过对与桃果实近核色素紧密连锁的SRAP标记Me07Em02扩增得到的片段进行了验证、回收、测序和分析,并登录桃基因组Peachv1.0进行比对,获得部分copia-like反转录转座子的部分

【作者】

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闫希光王召元常瑞丰刘国俭陈湖徐金涛李永红韩继成

【机构】

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河北省农林科学院昌黎果树研究所

【出处】

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农业科学与技术:英文版

【发表日期】

：

2018年5期

【关键词】

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【基金项目】

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河北省财政项目(Nos.F18R06001-1,F18R06001-2,F18R19-1002),国家现代桃产业技术体系项目(CARS-30-Z-02),河北省支撑项目(17226341).

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通过对与桃果实近核色素紧密连锁的SRAP标记Me07Em02扩增得到的片段进行了验证、回收、测序和分析,并登录桃基因组Peachv1.0进行比对,获得部分copia-like反转录转座子的部分序列,应用DANMAN和DNASTAR序列分析软件辅助,在桃基因组数据库和GenBank中进行BLASTn比对获得了桃copia-like反转录转座子的全基因组序列,位于Peachv1.0基因组的Scaffold-1的9939764~9944771bp位置,全长5008bp,其左右两边的长末端重复序列(LTR)完全一

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