库蠓中盖塔病毒的分离及其分子鉴定

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cnars
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

探讨1株(SZC30)云南省库蠓分离病毒的分类及分子特征。

方法

2013年7月采用灯诱的方法在云南省曲靖市师宗县五龙乡采集库蠓,采用BHK-21和C6/36细胞进行病毒分离,阳性分离物脑内接种1日龄乳鼠;分别用甲病毒属和盖塔病毒特异性引物对阳性分离物进行RT-P C R扩增、测序,用Clustal X1.83、BioEdit、DNAStar、 Mega5.1等生物信息学软件进行序列分析。

结果

采集到库蠓共3 500只,库蠓分为41批进行病毒分离,其中分离到一株病毒(SZC30)对BHK-21与C6/36细胞产生明显病变;分别用甲病毒属和盖塔病毒NS1特异性引物进行RT-P C R扩增结果为阳性;NS1基因序列分析结果显示SZC30株病毒与YN0540及SC1210两株中国分离的盖塔病毒位于同一进化分支内,核苷酸同源性在97%~100 %之间,氨基酸同源性在97%~100%之间。

结论

从云南省采集库蠓中分离到的SZC30株病毒为盖塔病毒。

其他文献
目的对1株从11月龄感染人禽流感的婴儿中分离的H9N2亚型禽流感病毒进行全基因组特征分析,推测可能的感染来源。方法从流感哨点监测医院采集流感样病例咽拭子标本,采用细胞分离方法分离流感病毒,对细胞分离物采用血凝试验、血凝抑制试验和荧光PCR的方法进行流感病毒的型别和亚型的鉴定,并对分离的病毒进行全基因组序列测序,对测定的核酸序列和推导的氨基酸序列采用生物信息学软件构建进化树进行比对分析。结果从1例婴
目的探讨HIV/AIDS合并涂阴肺结核的临床特征和诊断方法。方法收集2013年1月-—2015年9月住院的112例HIV/AIDS合并痰抗酸菌涂片阴性肺结核患者的有关临床资料。统计其临床症状出现的频率,血常规、血生化、T淋巴细胞亚群检测、痰涂片找抗酸杆菌、痰结核菌培养、 PPD试验,血T-SPOT.TB、TB-DNA和胸部CT等检查的结果,分析各指标的诊断特异性和灵敏度。结果112例患者临床表现,
目的探讨HIV感染者外周血滤泡辅助性T细胞(Tfh)及其亚群分布情况以及与病情进展的相关性。方法采用流式细胞术检测20例未经治疗的HIV感染者,20例经HAART后病毒完全抑制的HIV感染者,以及15例健康人外周血Tfh及其亚群的频率,分析其与病毒载量、CD4 T淋巴细胞计数及血浆丙种免疫球蛋白浓度的相关性。结果与健康对照组相比,未治疗组外周血Tfh17频率明显降低(P<0.05),与血浆丙种免疫
期刊
目的了解4种人冠状病毒(HCoV-HKU1、HCoV-NL63、HCoV-OC43、HCoV-229E)在福州急性重症下呼吸道感染患儿中的感染状况及临床意义。方法收集2007年11月至2015年1月因呼吸道感染住进医院儿科重症监护病房的小儿鼻咽抽取物标本,共计266份。通过RT-PCR法先用一对通用引物对人冠状病毒pol基因片段进行检测。测序并BLAST比对分析8份阳性产物。对用HCoV通用引物检
目的了解河北省诺如病毒(Norovirus, NoV)感染性腹泻疫情的病原流行特点及基因型变异情况。方法收集2015年1月至2016年12月间,共8起感染性腹泻疫情临床标本和相关临床信息,采用实时荧光RT-PCR法检测NoV核酸,阳性标本经传统RT-PCR扩增衣壳蛋白区部分序列进行测序和系统进化分析。结果河北省2015年1月至2016年12月间共发生8起腹泻疫情,病例265例,7起疫情中检测到No
目的应用分子检测方法,对输入性黄热病病例进行实验诊断。方法采集病例血清和尿液标本,应用实时荧光定量逆转录PCR(Real-time RT-PCR)法检测黄热病毒特异性核酸;套式RT-PCR法扩增病毒基因片段,序列测定或片段长度多态性法鉴别野毒株或疫苗株。结果Real-time RT-PCR法检测5例黄热病毒核酸阳性病例,病毒在尿液标本中存在时间较血清中存在时间更长,序列测定及限制性片段长度多态性法
人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,hPIVs)属于副粘病毒科的单股负链RNA病毒,也是引起呼吸道感染的主要病原体,其中hPIV3是引起六个月以下婴幼儿发生细支气管炎和肺炎的第二大病原体,仅次于呼吸道合胞病毒。本文主要介绍人副流感病毒3型的两种与毒力相关的表面糖蛋白、血凝素神经氨酸酶(HN)蛋白和融合蛋白(F),根据国内外最新的研究进展,介绍其蛋白结构和生理学功能
人诺如病毒(Norovirus,NoV)是单股正链的RNA病毒,它是引起全球急性胃肠炎流行和暴发的主要病原体之一,目前已经受到越来越多的关注。由于缺乏合适和成熟的动物模型和体外细胞培养模型,人们对人诺如病毒的流行病学及其基因变异特征的研究较多,但对于病毒的生物学特性、病毒编码蛋白的功能特征及病毒感染和致病机制知之甚少。本文简要总结了诺如病毒非结构蛋白的研究进展,并期望随着最近人诺如病毒体外细胞培养
目的白细胞介素-6(IL-6)在慢性病毒性肝炎发病机制和相关的肝脏疾病中有重要的作用,本文拟通过大样本病例-对照研究以及临床数据分析探讨IL-6单核苷酸多态性与HBV感染易感性的相关性,从而达到能够通过检测机体IL-6基因的表达的水平来预防和治疗HBV感染的目的。方法选取深圳地区汉族HBV病患者共计848例,对照组894例,抽提基因组DNA,运用TaqMan探针的技术对上述标本的rs1 800 7