【摘 要】
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目的 以药用植物萹蓄Polygonumaviculare为材料，利用高通量技术测定基因组DNA序列，对叶绿体基因组进行组装和序列分析，为进一步开展药用植物萹蓄的群体遗传学和遗传多样性研究奠定基础。方法 利用华大MGISEQ-2000PE150测序平台，双末端测序策略对其全基因组DNA建库测序，测定萹蓄的基因组DNA序列，用NOVO Plasty组装叶绿体基因组，采用最大似然法（maximum li
【基金项目】
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国家自然科学基金面上项目（31770370）； 河南省高等学校重点科研项目计划（18A360006）；
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目的 以药用植物萹蓄Polygonumaviculare为材料，利用高通量技术测定基因组DNA序列，对叶绿体基因组进行组装和序列分析，为进一步开展药用植物萹蓄的群体遗传学和遗传多样性研究奠定基础。方法 利用华大MGISEQ-2000PE150测序平台，双末端测序策略对其全基因组DNA建库测序，测定萹蓄的基因组DNA序列，用NOVO Plasty组装叶绿体基因组，采用最大似然法（maximum likelihood,ML）构建系统进化树。结果 萹蓄叶绿体基因组全长为163 461 bp,GC值37.5%，具1个典型的四分区域结构，包括1个大单拷贝区（large single copy region,LSC）、1对反向重复区（inverted repeats,IR）和1个短单拷贝区（small single copy,SSC），序列长度分别为88 023、31 066、13 306 bp。萹蓄的叶绿体基因组共有130个基因，其中编码蛋白基因、r RNA基因与t RNA基因的数量分别为83、8、37个。系统进化分析表明，萹蓄与木蓼属的额河木蓼构成一单系分支，具有100%支持率。结论 萹蓄隶属于蓼科的蓼属，与木蓼属的额河木蓼亲缘关系较近。萹蓄叶绿体基因组的组装、序列特征、间隔区的筛选及系统进化分析为后续开展群体遗传学和遗传多样性研究奠定基础。
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