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福建省农科院是省级农业科研单位，下属有14个研究所，财务独立核算。自2002年起全院实行了会计电算化，普遍反映良好。会计电算化的实行使财务人员从繁琐的记账、算账中解脱出来，有更多的精力参与管理。为了便于全院统一管理，从2006年开始，通过VPN专线实现了全院14个研究所的会计联网，各所的会计核算数据都存储在院计财处的服务器上。