STR和SNP对3个小鼠1号染色体替换系筛选结果的比较

来源 :实验动物与比较医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：w_wallace

【摘要】

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目的比较STR和SNP对3个1号染色体替换系的分型结果，并为每个替换系选择合适的基因分型方法。方法采用20个SNP和10个STR位点分别对3个1号染色体替换系N2代各40个样本进行分型。

【作者】

：

赵丽亚赵莹晁天柱刘磊邢正弘陈国强肖君华

【机构】

：

上海西普尔一必凯实验动物有限公司,上海实验动物研究中心,东华大学

【出处】

：

实验动物与比较医学

【发表日期】

：

2012年5期

【关键词】

：

1号染色体替换系 STR SNP 分型比较 Chromosome 1 substitution strains STR SNP Typing Comp

【基金项目】

：

上海市科学技术委员会科研计划项目（08140900901,10140900101）

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目的比较STR和SNP对3个1号染色体替换系的分型结果，并为每个替换系选择合适的基因分型方法。方法采用20个SNP和10个STR位点分别对3个1号染色体替换系N2代各40个样本进行分型。结果采用20个SNP位点，从C3H／He替换系中筛选到6个样本，从FVB／N替换系中筛选到9个样本，从AKR替换系中筛选到4个样本。采用10个STR位点，从C3H／He替换系中筛选到6个样本，从FVB／N替换系中筛选到10个样本，从AKR替换系中筛选到6个样本。结论根据每个品系基因组背景不同，可选择三组多重STR方案作为C

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