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生物信息数据库中存储信息数量巨大,数据类型复杂多样,浏览和查询机制的效率较低。为了将网络上分布的、异构的生物信息数据库实现数据整合与共享.提出一个基于XML的异构生物信息数据库整合系统,设计系统的体系结构,阐述各模块的主要功能,介绍生物公共数据模型以及XML的特点,对基于XML的生物信息数据格式转换的步骤进行探讨。