利用Illumina MiSeq测序平台分析沐川乌骨黑鸡空肠微生物多样性

来源 :江苏农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dh184866884
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  摘要:为探索沐川乌骨鸡肠道微生物多样性,采用Illumina MiSeq测序平台对10羽沐川乌骨鸡的空肠内容物样本中微生物的16S rDNA-V4变异区进行测序,利用UPARSE等软件分析和统计样品中的操作分类单元(OTUs)数量,并进行物种注释及丰度分析,揭示样品的物种构成。结果表明,共获得667 466条tags,在97%相似水平上进行OTU分类,被归类于3 154个OTUs,且由稀释曲线可知此次测序结果较全面地覆盖了沐川乌骨黑鸡空肠微生物群落。门水平上,占优势的门主要有厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria),但这3种优势菌门在不同样品中所占比例均有所差异。在属水平上,在10个样品中所占比例均大于1%的菌属有乳杆菌属(Lactobacillus)和Romboutsia菌属。
  关键词:沐川乌骨黑鸡;Illumina MiSeq测序;空肠;微生物;多样性
  中图分类号: S831;S182
其他文献
为了解鸽毛滴虫黏附蛋白AP33的理化特性、抗原性和细胞表位的特性,通过在线工具和软件分析了鸽毛滴虫黏附蛋白AP33的理化特性、二级结构、抗原性、T细胞表位和B细胞表位。结
“好奇”号火星探测器自2011年11月25日发射以来,经8个多月、5.6亿公里的长途跋涉,于今年8月6日顺利登陆火星,并随即发回了登陆地附近火星地貌的清晰照片,这令探测器的“东家”—
关于态度,我们会有说不完的话题,一个良好的态度的建立,是我们生存的一项必备紊质。
工业和信息化部近日印发《工业互联网创新发展行动计划(2021-2023年)》,提出到2023年,我国2020年,我国国企改革三年行动大力实施,重点领域改革扎实推进,“双百行动”、“科改
2019年6月,河南郑州某鲤养殖场发生鲤急性烂鳃病,累计死亡率约40%。为研究发病病因和疾病流行规律,对病鱼解剖,进行细菌和寄生虫检测、组织病理学检测、PCR检测和系统进化分
为了促进当前中小型企业的信息化建设,需要对信息化的整体控制系统设计方法进行研究。目前方法采用1个主机与3个从机的总线型主从式结构,但存在系统响应时间较长,网络负载均
4月20日上午,曹庆年校长代表学校与喀山国立技术大学签订合作备忘录。签字仪式由国际合作与交流处处长蔡应昌主持。
传统的自动评分系统对商务英语中的文本翻译信息进行评定时,标准题型的评分准确性较高,主观题型的评分准确性较低。为了解决这一问题,基于XML结构设计一种新的自动评分系统。
通过室内盆栽试验,对比了一年生黑麦草、南方多年生黑麦草、北方多年生黑麦草、冬牧黑麦草和紫花苜蓿等5种牧草对南美白对虾池塘底泥中氮、磷、有机质和重金属的修复效果。结
1.深呼吸好吧,我知道这是老生常谈了,但是呼吸训练真的可以帮助调节情绪,让身体和心情都自然地平静下来。当呼吸浅而且急促时会激发身体的警觉,大脑会根据身体的警觉状况自动调整