研究采用长链非编码RNAs(LncRNAs)测序技术筛选黄芪甲苷(AS-IV)干预急性肾损伤(AKI)大鼠过程中肾组织相关LncRNAs的变化。
方法选取雄性SD大鼠8只，采用随机数字表法分成两组，AKI模型组(组1)：4只大鼠进行缺血再灌注(I/R)处理；AS-IV预处理组(组2)：4只大鼠I/R处理前7 d分别进行AS-IV灌胃处理，I/R处理24 h后取肾组织，提取总RNA并进行质量检测，合格后进行测序实验，以差异倍数(组1/组2)≥2且P≤0.05为纳入标准，检测AKI模型组和AS-IV预处理组中的LncRNAs差异表达谱，并对差异LncRNAs进行基因本体论(GO)分析和通路(Pathway)分析，从而了解LncRNAs参与的生物学功能。
结果两组相比，差异表达的LncRNAs共232条，其中127条表达上调，105条表达下调。发现341条mRNA表达出现差异性变化，其中178条表达上升和163条表达下降。通过GO分析获得mRNA参与的细胞生物过程、细胞组件和分子功能，LncRNAs共表达的mRNA主要参与核小体组装、染色质组装或分解、核小体组织、DNA构象变化、蛋白质-DNA复合物组装等生物过程，参与的细胞组件包括核小体、蛋白质-DNA复合物、核染色质、染色质和核核小体等成分，体现了蛋白质异源二聚反应活性、蛋白二聚化活性、DNA结合活性和核酸结合活性等分子功能。细胞通路分析LncRNAs共表达的mRNAs所参与的信号通路主要涉及到系统性红斑狼疮途径、酒精代谢途径、病毒致癌机制等，共同调控着黄芪甲苷保护AKI的生物学进程。
结论AKI模型组和AS-IV预处理组大鼠肾组织中存在差异表达的LncRNAs，生物学功能和通路分析提示这些差异表达LncRNAs可能参与黄芪甲苷改善AKI的作用机制。