【摘 要】
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目的评估粪便样本的不同保存条件对肠道微生态研究结果的影响。方法设计相关实验,比较7种不同的保存方法,基于高通量测序技术比对不同时间、不同贮存温度对粪便样本DNA质量、菌群多样性及病原菌检出等结果之间的差异。结果证实了对于粪便样本采集仍建议采取即刻提取核酸或-20℃保存的方法。同时比较多种保存方法后发现,采用不同样本保存方法受到影响的菌属集中在低丰度菌属(≤0.01%),对应较高丰度的病原菌检测结果的可靠性影响较小,样本中丰度超过千分之一的病原菌检测率超过95%。结论对于肠道微生态研究建议对粪便样本采取即刻
【机 构】
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中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
【基金项目】
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国家科技重大专项(2018ZX10305410),生物安全关键技术研发(2018YFC1200100)。
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目的评估粪便样本的不同保存条件对肠道微生态研究结果的影响。方法设计相关实验,比较7种不同的保存方法,基于高通量测序技术比对不同时间、不同贮存温度对粪便样本DNA质量、菌群多样性及病原菌检出等结果之间的差异。结果证实了对于粪便样本采集仍建议采取即刻提取核酸或-20℃保存的方法。同时比较多种保存方法后发现,采用不同样本保存方法受到影响的菌属集中在低丰度菌属(≤0.01%),对应较高丰度的病原菌检测结果的可靠性影响较小,样本中丰度超过千分之一的病原菌检测率超过95%。结论对于肠道微生态研究建议对粪便样本采取即刻
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