【摘 要】
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目的通过对胶质瘤公共数据的挖掘研究Ⅰ型胶原蛋白α2链(COL1A2)在胶质瘤中的表达和临床意义,并通过基础细胞功能实验验证其对胶质瘤细胞系迁移和侵袭的影响。方法通过对Oncomine数据库中与COL1A2相关数据的深入发掘,对其在不同类型肿瘤及不同级别和不同分子分型胶质瘤中的表达情况进行荟萃分析,接下来使用中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库进行挖掘,分析COL1A2表达量与胶质瘤患者预后之间的联系。使用基因本体论(GO)和Pathway方法对COL1A2基因进行功能注释,最后通过构建过表达和敲减CO
【机 构】
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目的通过对胶质瘤公共数据的挖掘研究Ⅰ型胶原蛋白α2链(COL1A2)在胶质瘤中的表达和临床意义,并通过基础细胞功能实验验证其对胶质瘤细胞系迁移和侵袭的影响。
方法通过对Oncomine数据库中与COL1A2相关数据的深入发掘,对其在不同类型肿瘤及不同级别和不同分子分型胶质瘤中的表达情况进行荟萃分析,接下来使用中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库进行挖掘,分析COL1A2表达量与胶质瘤患者预后之间的联系。使用基因本体论(GO)和Pathway方法对COL1A2基因进行功能注释,最后通过构建过表达和敲减COL1A2的胶质母细胞系细胞株进行细胞功能实验验证其对胶质瘤细胞系迁移和侵袭的影响。
结果Oncomine数据库中共收集关于COL1A2在不同类型肿瘤的研究成果并且差异有统计学意义的研究成果共114项,其中结果显示COL1A2表达增高的研究有103项,表达量较正常组织降低的研究有11项;分析显示在胶质瘤中COL1A2高表达的研究有22项。分析不同级别胶质瘤以及不同分子类型的胶质瘤与对照组相比,COL1A2在各种类型的胶质瘤中高表达,且越高级别胶质瘤其表达量越高(P
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