三穗鸭ITPR2基因组织表达、功能预测及其SNPs对蛋壳品质的影响

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1,4,5-三磷酸肌醇Ⅱ型受体(inositol 1,4,5-trisphosphate receptor typeⅡ,ITPR2)是钙离子跨膜转运活性的关键调控因子,影响蛋壳品质.本研究以贵州三穗鸭(Anas platyrhyncha domestica)为研究对象,利用qRT-PCR检测ITPR2基因的组织表达,将PCR纯化直接测序法结合DNAStar筛查鉴定蛋白结构域的SNP位点,运用一般线性模型分析SNP位点对蛋壳品质的遗传效应.结果显示,三穗鸭ITPR2基因在11个组织中均有表达,表达量依次为胰腺>蛋壳腺>腺胃>肾>胸肌>脾>小肠>肺>肝>心脏>肌胃,且胰腺和蛋壳腺表达量极显著高于其他组织(PT、g.128662092 C>T之间存在强连锁不平衡;g.128659402 G>T和g.128767757 A>G突变位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(PT影响蛋壳品质,其TT基因型显著增加蛋壳强度(P<0.05);3个SNPs联合产生4种单倍型和10种双倍型,H4为优势单倍型,H2H4为优势双倍型;组合基因型对蛋壳品质具有不同程度影响,其中H1H1和H1H2显著提高蛋壳品质强度(PT突变位点CT基因型有利于提高蛋壳强度;3个SNP位点相互联合能显著蛋壳品质,可作为鸭蛋壳品质选择的遗传标记.
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