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核糖体DNA的内转录间隔区ITS序列包含被5．8S rDNA所分隔的ITS1和ITS2两个片段，在被子植物中，ITS序列的长度稳定且序列变异较快，可以提供丰富的信息位点，是被子植物鉴定中的重要分子标记。通过毛黄堇和石生黄堇的rDNA ITS序列测试对两个物种进行了鉴别，并对核rDNA ITS序列在药用植物种质资源鉴定中的应用进行了简要介绍。