【摘 要】
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以荨麻(Urtica fissa L.)叶绿体基因组为研究对象,筛选出56条CDS序列,通过中性绘图分析、ENC绘图分析和PR 2绘图分析,探究其密码子的使用模式.结果表明,荨麻叶绿体基因组中密码子第3位偏好以A/T碱基结尾,密码子使用模式主要受自然选择的影响,最优密码子分析中确定GCT、CGT等15个最优密码子,且大多数以A和T结尾.本研究结果为提高外源基因在荨麻叶绿体中的表达效率提供了一定的参考.
【机 构】
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安顺学院农学院, 贵州 安顺 561000;贵州大学农学院, 贵阳 550025;安顺学院农学院, 贵州 安顺 561000;清镇市第一中学, 贵州 清镇 551400;贵州大学农学院, 贵阳 550
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以荨麻(Urtica fissa L.)叶绿体基因组为研究对象,筛选出56条CDS序列,通过中性绘图分析、ENC绘图分析和PR 2绘图分析,探究其密码子的使用模式.结果表明,荨麻叶绿体基因组中密码子第3位偏好以A/T碱基结尾,密码子使用模式主要受自然选择的影响,最优密码子分析中确定GCT、CGT等15个最优密码子,且大多数以A和T结尾.本研究结果为提高外源基因在荨麻叶绿体中的表达效率提供了一定的参考.
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