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革兰氏阴性菌的包被结构中,肽聚糖层以凝胶态存在并与外膜紧密相联。微孔蛋白分子的疏水面在膜内侧,亲水部分在膜上部形成充水的管道,其特异性由所带受体决定。在R型菌及含有脂寡糖(LOS)的细菌可使疏水物质通过,而多聚阳离子有自身促进摄取作用。外膜是许多外部附件的锚定部位,并参与保持细胞形态的功能。