日本研究中国历史的组织较多，其中有一部分是所、部、会、刊物成套，人员、图书、资料、设备比较齐全，并有国际交往。这些研究中国历史的组织编辑出版了许多有关中国历史的论著，仅东京大学史学会的《史学杂志》及其他部分杂志，在一九七五年到一九七七年刊载的中国古代史的论著目录，约一千篇（本）之多，内容包括通史、断代史、专题史和各种专题。现择其要者，简介如下：东京大学是日本历史最久的研究中国历史的中心。一九四一年设立以中国为重点的、对东方各国历史、法律、经济、哲学、宗教、语言、文学、民族学和考古学进行综合研究的东洋文化研究所。其中，中国历史部分占有相当的比重。一九四三年开始出版《东洋文化研究所纪要》。截至一九七四年止，《纪要》发表的论文绝大部分为中国古代史，现代史部分不足十分之一。该所藏书较多，在中国书籍中，有一些是珍本，曾出版《东京大学东洋文化研究所汉籍分类目录》，32开本，共1174页。