【摘 要】
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目的 预测和分析牛乳腺炎粪肠球菌溶血素CylA基因的抗原性和相关的理化性质.方法 克隆牛乳腺炎粪肠球菌溶血素CylA基因,并在测序基础上利用生物信息软件分析CylA基因编码的多肽抗原可及性及其理化特性.结果 成功克隆CylA基因,经测序CylA基因序列序长度为978 bp,与NCBI上公布的CylA序列(JQ794947.1)相似度为99.0％,核苷酸序列有5处出现变异,分别是168位的碱基由T→G,587位碱基由C→T,735位插入碱基C,781位插入碱基G,826位碱基由T→A.利用生物信息学软件分析
【机 构】
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内蒙古民族大学生命科学与食品学院,内蒙古通辽028042;内蒙古自治区乳源性致病菌防控工程技术研究中心;内蒙古民族大学乳源性致病菌研究所;内蒙古民族大学生命科学与食品学院,内蒙古通辽028042
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目的 预测和分析牛乳腺炎粪肠球菌溶血素CylA基因的抗原性和相关的理化性质.方法 克隆牛乳腺炎粪肠球菌溶血素CylA基因,并在测序基础上利用生物信息软件分析CylA基因编码的多肽抗原可及性及其理化特性.结果 成功克隆CylA基因,经测序CylA基因序列序长度为978 bp,与NCBI上公布的CylA序列(JQ794947.1)相似度为99.0％,核苷酸序列有5处出现变异,分别是168位的碱基由T→G,587位碱基由C→T,735位插入碱基C,781位插入碱基G,826位碱基由T→A.利用生物信息学软件分析其理化性质结果显示,该片段多肽相对分子质量为27.5 ku,等电点为4.69,带负电荷残基39个,带正电荷残基26个,分子式为C1213H1920N326 O393 S3,a螺旋占29.69％,β折叠占9.77％,无规则折叠占37.87％,2～25位氨基酸为跨膜区;具有良好的抗原可及性,从2～8位氨基酸,从92～160位氨基酸区间均匀分布抗原可及性.结论 溶血素CylA基因编码多肽具有明显的跨膜分泌特性,丰富的折叠结构和广泛区域的抗原可及性,对相应基因工程疫苗的研制及检测抗原开发具有重要意义.
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