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渔业产业化是实现我国渔业产业结构第二次调整、发展现代渔业的重要途径之一。而渔业产业化的内涵与特征决定了其运行机制包涵：内部利益协调机制、风险保障机制、市场开发机制、科技进步机制、投融资机制、政府助推机制、服务保障机制等。目前我国渔业产业化运营利益协调机制不健全，科技创新、市场开发、服务保障机制滞后，风险保障机制、生态补偿机制不健全，不适应渔业快速发展的需要。应加快完善渔业产业化运营机制，促进渔业生产规模化、标准化、产业化。