【摘 要】
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目的 基于生物信息学筛选胃癌组织中差异表达基因,探讨胃癌组织及肝转移癌组织中差异基因的表达情况,并结合中医“脾虚生痰湿”理论寻找可作为胃癌肝转移过程中的节点因子.方
【机 构】
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中国医科大学北部战区总医院研究生培养基地,辽宁沈阳110016;辽宁中医药大学,辽宁沈阳110847;辽宁中医药大学中医脏象理论及应用国家教育部重点实验室,辽宁沈阳110847;中国医科大学附属第一医
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目的 基于生物信息学筛选胃癌组织中差异表达基因,探讨胃癌组织及肝转移癌组织中差异基因的表达情况,并结合中医“脾虚生痰湿”理论寻找可作为胃癌肝转移过程中的节点因子.方法 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃癌相关数据集,分析肿瘤组织与正常组织之间基因的表达差异,利用单因素和多因素回归分析筛选具有独立预后作用的差异基因,进而构建风险模型,使用此模型来计算患者风险评分并绘制生存曲线,所选分子将通过临床样品进一步验证.结果 在将胃癌组织与正常组织进行比较的过程中,共发现695个差异表达基因(P<0.0S),其中上调47个、下调648个.通过多因素回归分析,筛选出7个高表达、与预后有关的基因(P<0.05).我们基于预后风险模型计算了患者风险值,根据患者风险评分绘制的生存曲线表明,高危组和低危组的生存预后有显着差异(P<0.05).此外,临床样品的Real-time PCR.检测表明,胃癌及肝脏转移病灶中DNMT3B和TRMT6表达增加,这与该研究生物信息学分析结果一致.结论 基于TCGA数据库,该研究分析了胃癌基因差异表达与临床数据的关系,并建立了差异基因的预后模型.在临床样品中进一步证实了两个新分子(DNMT3B和TRMT6)在胃癌肝转移过程中具有重要的生物学功能,同时与中医“脾虚生痰湿”理论相结合进行阐述,该研究有可能为胃癌的早期诊断及预后提供新的靶标.
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