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金色链霉菌Streptomyces aureofaciens DM-1是去甲基金霉素的高产菌株.通过Genome Sequencer FLX系统进行测序,得到一条完整的线性基因组序列,长度为6 824 334 bp,GC含量为72.6％.结合软件glimmer 3.02、Genemark和Z-Curve program进行基因预测,最终在其基因组中鉴定出6 431个基因.应用AntiSMASH软件预测其基因组中存在28个次级代谢生物合成基因簇,其中包含了去甲基金霉素生物合成基因簇.其中甲基转移酶CtcK因移码突变提前终止翻译,很可能是去甲基金霉素相对金霉素(CTC)缺失一个甲基的根本原因.研究结果为S.aureofaciens DM-1的功能基因组学和去甲基金霉素高产菌株育种提供了研究基础.