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病原体在多种宿主间跨种传播是一个复杂的动力学过程，对传染病早期预警系统的可靠性提出严峻挑战。本文通过介绍传染病生态学理论方法，回顾和总结了通过环境-宿主-传染病动态数学模型研究病原体、宿主以及环境的交互作用，量化环境对疫情趋势、传播媒介以及病原微生物影响的研究范式；并以我国姬鼠型肾综合征出血热研究为例，介绍了传染病数学模型在疫情实际预测预警中的应用，进一步发展了新的监测指标与预警方法。