实时荧光定量RT—PCR快速检测H7N9禽流感病毒

来源 :国际流行病学传染病学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:iamc66m
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目的 构建一种灵敏、特异、快速的实时荧光定量RT—PCR反应体系用于临床H7N9禽流感疑似病例早期诊断及外环境H7N9病毒的监测。方法以H7N9禽流感病毒H7基因和N9基因为靶基因设计引物以及TaqMan探针,并对引物、探针及反应条件进行优化,验证该反应体系检测的特异性、灵敏度、重复性和检测速度,然后与两种商品化试剂盒(试剂盒I和试剂盒Ⅱ)进行各项指标及184份现场样本作平行比对。结果新建立的H7N9禽流感病毒实时荧光定量RT-PCR反应体系呈典型的扩增曲线、扩增时间约50min,H7基因与N9基因的最低检出限分别为28拷贝/μL与41拷贝/μL。重复性测定显示,H7和N9检测Ct值的变异系数(CV)分别为0.17%~0.89%和0.33%~0.59%,扩增效率分别为0.9491和0.9713;与其他常见禽流感病毒或肠道病毒无明显交叉反应。184份现场可疑样本阳性检出率为5.43%(10/184),与试剂盒Ⅱ结果一致。结论本研究建立的实时荧光定量RT—PCR反应体系具有检测速度快、灵敏度高、特异性强、重复性好、结果可靠等特点,可用于临床疑似病例的应急检测、早期诊断及养鸡场、活禽交易市场等外环境H7N9禽流感病毒监测。

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