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目的分析深圳市非结核分枝杆菌（NTM）的流行状况,为NTM病防控策略提供依据。方法搜集2013-2017年深圳市慢性病防治中心和各区慢性病防治院收治的37 630例疑似肺结核患者,对上述患者进行痰分枝杆菌培养（BACTEC MGIT 960和改良罗氏法）检出阳性菌株8850株,采用MPB64免疫胶体金法和对硝基苯甲酸生长试验进行结核分枝杆菌复合群和NTM的初步菌种鉴定,对初步菌种鉴定为NTM的菌株应用HAIN基因分型鉴定法进行NTM菌种鉴定。分析NTM菌株在不同年度、性别、年龄、感染类型、地区来源、户籍来源,以及NTM不同种类菌株的分布特征。率的比较采用X2检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果 8850株分枝杆菌培养阳性菌株中,初步菌种鉴定获得366株NTM菌株,检出率为4.14%（366/8850）; HAIN基因分型鉴定法确定293株NTM菌株的菌种,鉴定率为80. 05%（293/366）。2013-2017年深圳市NTM的检出率呈轻微上升趋势[3. 81%（71/1864）～4. 50%（82/1821）],但各年度间差异无统计学意义(X2趋势=1.159,P=0. 885)。366例NTM感染患者中,女性患者的检出率[4.87%（144/2957）]明显高于男性患者[3.77%（222/5893）]（X2=6.038,P=0. 014）;感染的高峰年龄均为25～34岁,分别占28. 83%（64/222）和23. 61%（34/144）,差异无统计学意义（X2=1. 213,P=0. 271）。初治患者、郊区患者、流动人口患者、郊区流动人口患者的NTM检出率[分别为2.31%（187/8104）、1.77%（105/5909）、3.89%（324/8323）、1.61%（91/5663）]明显低于复治患者[23. 99%（179/746）]、市中心患者[8.87%（261/2941）]、户籍人口患者[7.97%（42/527）]、城区流动人口患者[8.77%（235/2681）]（X2=810. 400、249. 512、20. 778、248. 418,P值均=0. 000）。293株NTM分离株中,构成比占前3位者依次为脓肿分枝杆菌[41.64%（122/293）]、鸟-胞内分枝杆菌[22. 18%（65/293）]、堪萨斯分枝杆菌[16.04%（47/293）];另外,发现7例[2. 39%（7/293）]混合感染类型。结论深圳市近几年NTM检出率稳定,分布种类多样,以脓肿分枝杆菌、鸟-胞内分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌为主;多见青壮年感染者,需重点关注女性、复治患者,以及来自市中心、户籍人口、城区流动人口患者的流行情况。