目的：总结比较新冠病毒Delta和Omicron变异株感染者的主要中医病机，为新冠病毒感染的证型演变和辨证思路提供参考。方法：收集2021年以来长沙地区收治的境外输入性及本土新冠病毒Delta和Omicron变异株阳性病例的中医诊治资料，其中Delta变异株感染者18例，Omicron变异株感染者36例，分析对比四诊信息和中医病机。结果：Delta株感染确诊患者以咳嗽、发热、胸闷/呼吸困难、身体酸痛、恶心、口干咽干、咽痛、舌苔厚腻、滑数脉多见，病机以上焦湿热、少阳郁热挟湿为主，其中胸闷/呼吸困难、腻苔、滑脉及判断为上焦湿热证的比例较Omicron株感染者更高，差异有统计学意义（P＜0.05）。Omicron变异株感染确诊患者以咽痒、咽痛、鼻塞、流涕、发热、轻度畏寒、口干、头晕症状以及淡红舌薄白苔、数脉或弦脉为主要表现，中医病机以风燥犯卫和少阳郁热为主，其中白苔舌象和风燥犯卫证的出现比例较Delta变异株感染者高，差异有统计学意义（P＜0.05）。结论：长沙地区收治的新冠病毒Delta和Omicron变异株感染者的中医病机分布有显著区别，Delta变异株感染倾向于表现为“湿热”特征，而Omicron变异株感染倾向于表现为“风燥”特征，这一差别可为新冠病毒感染的病机演化规律提供参考。