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产业集群合作创新相对于单个企业技术创新来说，过程要复杂得多，失败的风险也大得多。运用解释结果模型（ISM），详细分析产业集群合作创新过程中面临的政策环境风险、市场风险、合作主体风险、项目风险和项目管理风险五个风险子系统，并识别出各类风险子系统下的具体风险因素17项，模型分析结果显示，合作主体、创新项目及项目管理的大多数因子是影响合作创新的最直接因素，最深层次、最基本的因素则是合作者的创新能力、国家货币政策、政策行政效率、竞争对手的实力等创新主体无法控制的因素，创新过程中应该按照影响因素的级别采用不同的防范