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根据国家卫生和计划生育委员会办公厅、财政部办公厅《关于公布第二批住院医师规范化培训基地名录的通知》（国卫办科教函[2017]998号）及安徽省卫生和计划生育委员会、财政厅《关于公布安徽省第二批住院医师规范化培训基地名录的通知》（卫科教秘[2017]517号）文件通知,安徽省第二人民医院正式成为国家住院医师规范化培训基地。其中含有13个专业培训基地,分别是内科、急诊科、神经内科、全科、外科、外科（胸心外科方向）、外科（泌尿外科方向）、骨科、妇产科、眼科、耳鼻咽喉科、放射科、超声医学科等。