目的基于非靶向气相色谱-质谱串联(NTGC-MS)平台研究二甲双胍治疗多囊卵巢综合征(PCOS)前后整体代谢物的改变。方法观察41例二甲双胍治疗PCOS(POCS组)前后临床生化特征变化,应用NTGC-MS平台检测代谢相关指标。结果 PCOS患者存在糖脂和氨基酸代谢异常;健康对照组(NC,n=65)与PCOS组存在63种代谢差异物,二甲双胍治疗前后存在27种代谢差异物;PCOS主要存在丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢、柠檬酸循环、丙酮酸代谢等通路的改变,二甲双胍能改善牛磺酸和亚牛磺酸代谢、丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢等通路。结论二甲双胍能降低PCOS患者的体重并增强其IS,能改善糖脂及氨基酸代谢异常;NTGC-MS是研究PCOS整体代谢差异物、评估药物干预效果的有效工具。