【摘 要】
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目的运用生物信息学方法挖掘六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病(HIE)的lncRNA-miRNA-mRNA转录网络,探讨其作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘六味地黄汤活性成分及预测靶点,从GEO、miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库挖掘HIE差异表达的lncRNAs、miRNAs及mRNAs,使用R语言及Perl软件筛选六味地黄汤治疗HIE的关键lncRNAs、miRNAs及mRNAs,借助Cytoscape3.7.0软件与STRING数据库构建活性
【机 构】
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湖南中医药大学,湖南中医药大学第一附属医院,益阳医学高等专科学校
【基金项目】
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国家自然科学基金(82074251),湖南省卫生健康委员会科研计划项目(C2018032)。
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目的运用生物信息学方法挖掘六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病(HIE)的lncRNA-miRNA-mRNA转录网络,探讨其作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘六味地黄汤活性成分及预测靶点,从GEO、miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库挖掘HIE差异表达的lncRNAs、miRNAs及mRNAs,使用R语言及Perl软件筛选六味地黄汤治疗HIE的关键lncRNAs、miRNAs及mRNAs,借助Cytoscape3.7.0软件与STRING数据库构建活性
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