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摘要以南京小龙山植株海州香薷、根际土壤与非根际土壤作为材料得到可培养的植物内生细菌、根际细菌与非根际细菌，通过研究样品间的群落差异，来分析所得菌种对植株、土壤的作用与影响。将可培养细菌加入钾长石中，通过测定分析不同生境细菌对矿物的风化能力，筛选出具有高效释放矿质元素能力的菌株。该研究有助于丰富微生物资源库，了解植物内生细菌与不同土壤微生物的作用与联系，为深入阐明细菌的矿物风化作用机制打下基础。
关键词植物内生菌；土壤细菌；菌落差异；矿物风化；小龙山/南京
中图分类号S181.3文献标识码A文章编号0517-6611（2014）14-04391-03
Study on Colony Differences and Mineral Weathering of Endophytes and Soil Bacterium in Xiaolong Mountain in Nanjing
RUAN Zhepu（College of Life Sciences， Nanjing Agricultural University， Nanjing， Jiangsu 210095）
AbstractElsholtzia splendens， rhizosphere and nonrhizosphere soil in Xiaolong Mountain of Nanjing were selected as materials to get the cultivated bacterium， rhizosphere bacterial and nonrhizosphere bacterium， through study on colony differences， the function and influence of bacterium on plants and soil were analyzed. The cultured bacterium was added into Kfeldspar， the ability of the bacterium in different habitats on mineral weathering was studied， and the strain that has the ability to release mineral elements efficiently was obtained. This study contributes to enrich repository of microorganisms， understand the action and contact between different endophytic bacterium and microbial， and lay the foundation for elucidating the mechanism of mineral weathering bacterium deeply.
Key wordsEndophytes； Soil bacterium； Colony differences； Mineral weathering； Xiaolong Mountain of Nanjing
摘要
该研究从南京小龙山采集海州香薷植株、根际土壤与非根际土壤作为试验材料。从3种材料样品中分离、纯化得到可培养的植物内生细菌、根际细菌与非根际细菌，通过PCRDGGE法研究3种样品之间的细菌群落差异，并由此来分析所得菌种对植株、土壤的作用与影响。将可培养细菌分别加入原位的钾长石中，通过对有效元素、铁载体、总酸度等指标的测定，来分析不同生境细菌对矿物的风化能力以及具有矿物风化能力的细菌类别，探明矿物风化细菌优势菌群，筛选出具有高效释放矿质元素能力的菌株。该研究有助于丰富微生物资源库，了解植物内生细菌与不同土壤微生物的作用与联系，为深入阐明细菌的矿物风化作用机制打下试验基础；对小龙山微生物多样性的调查研究，为保护小龙山-南京的“城市绿肺”的生物多样性提供依据与材料。
2立论依据
生物风化是指矿物、岩石受生物生长及活动影响而发生的风化作用，包括动物、植物和微生物与矿物相互作用等，是在地表发生的最重要的地球化学现象之一[1-4]。在地球表层土壤中，微生物的活动可以导致矿物被破坏，并从矿物中释放出大量植物生长必需的营养物质、金属及非金属元素等提供给植物的生长，而植物生长发育过程中的代谢产物由根部分泌至土壤中，改变了周围土壤的物理和化学性质，使得微生物更易生存，繁殖；并且，这些代谢产物还成为了根系范围内微生物的有效营养物质[5-7]。植物内生菌与土壤细菌群落的种类及差异的研究，不仅有助于了解不同环境下的细菌之间的差异、微生物的生物多样性以及其对生存环境所造成的影响，为研究植物对所处土质的适应性分析以及土壤形成过程中微生物的作用提供有力的依据。
微生物在矿物风化进程中所起的作用不断被认识。Barker等指出，和对照相比，细菌在实验室培养条件下通过产生有机酸和无机酸及胞外聚合物能使Si和Al从斜长石中的溶出量增加两个数量级[8]。Jacob证明以细菌为优势种群的原核微生物群落的丰富度与玄武岩的不同风化程度呈显著正相关关系，最古老的、风化程度最高的玄武岩拥有最高的微生物生物量[9]。矿石表面的微生物能够加速矿物的风化进程，作用机理包括产生有机酸、无机酸、络合金属的配位体，改变氧化还原条件，或者间接产生次生矿物[10-13]。
矿物-微生物相互作用研究，不仅有助于深入了解土壤-微生物作用过程，而且对评估和预测土壤体系中养分元素的有效性也有重要实际意义[14-16]，因此，它已成为当前地质微生物学和土壤学领域的研究热点与前沿。但总体来讲目前这一領域的研究还不系统，许多理论问题还不清楚，关于矿区内植物内生及根际微生物分化矿物的研究鲜见报道。 该研究课题结合国内外对于矿物风化研究的进展，拟研究钾矿区超累积植物海州香薷内生菌、根际土壤与非根际土壤中可培养细菌对矿物的风化能力的强弱（以它们对钾长石的风化效力为标准），以及各样品风化矿物的细菌的主要类群，发现不同来源微生物之间的群落差异，及其与土壤环境的联系，证实不同来源的矿物风化菌群是否存在差异，存在哪些差异；并从中筛选出具有高效风化矿物能力的菌株，作为微生物肥料的候选菌株，也可以为研究矿物风化机理提供试验材料。为保护小龙山-南京的“城市绿肺”的生物多样性提供依据，也为利用微生物改善小龙山废钾矿区的生态环境提供了更多方法。
3研究方案
3.1项目研究的目标、内容和拟解决的关键问题
3.1.1研究目标。研究南京小龙山海州香薷根际土壤与非根际土壤的物理化学性质及植物内生菌及不同土壤中细菌的遗传多样性，筛选出具有明显风化钾长石的菌株，研究其生物学特性以及遗传多样性。从而说明植物内生菌与根际土壤细菌的关系，以及这些细菌对矿物风化、土壤形成的影响。
3.1.2内容。①土壤样品的组分及理化特性；②植物内生菌与根际及非根际土壤微生物的多样性；③筛选具有高效矿物风化能力的菌株，研究其生物学特性。
3.1.3拟解决的关键问题。①根际细菌与非根际细菌的分离、纯化；②植物内生菌、根际与非根际土壤微生物多样性分析；③高效风化能力菌株的筛选。
3.2拟采取的研究方法、技术路线、试验方案及可行性分析
3.2.1研究方法。①不同土壤组成成分分析：将土壤收集2 μm以下粘土矿物做成涂片后进行XRD分析；②海州香薷内生细菌的分离：75%的乙醇消毒后研钵研磨，稀释涂布于YN平板上，置于培养箱培养3 d，对平板上生长的菌落进行纯化后保藏；③土壤样品中细菌的分离：采用稀释涂布法，用YN培养基分离纯化；④细菌的DNA提取、16S rDNA的PCR扩增及其菌株鉴定：参考《分子生物学实验指导》[17]方法提取菌株的总DNA，然后进行PCR扩增，送测序公司进行测序，将测序结果用Blast软件与GenBank数据库进行比对分析；⑤细菌矿物风化能力的测定：物理性质上使用电镜观察钾长石表面的磨损情况，用X射线衍射鉴定矿石成分，化学上参考盛下放等方法（采用ICP-AES测定溶液中有效矿质元素含量等）测定菌株释放矿质元素能力[18]；参考王平等方法测定菌株产铁载体的能力[19]。
3.2.2技术路线。见图1。
图1小龙山钾矿区海州香薷和土壤样品中微生物筛选技术路线3.2.3试验方案。
3.2.3.1不同土壤组成成分分析。取少量土壤悬浊液，测定土壤中的有机质含量，有效态矿质元素含量，尿酶与蔗糖酶的活性及pH。通过XRD测定土壤粘土矿物的组成。
3.2.3.2根际细菌与非根际细菌的分离纯化。用抖根法将根际土壤与非根际土壤分离，抖落的土壤为非根际土壤，附着在根系表面的为根际土壤。用稀释平板法分别分离根际细菌和非根际细菌，挑选单菌落进行划线纯化、保藏。
3.2.3.3植物内生细菌的分离纯化。将采集回的新鲜海州香薷进行表面消毒，放入固体平板中培养24 h，待平板长出菌落，用划线、稀释等分离方法，经过分离、筛选、纯化的反复过程，直至得到纯化的典型菌落。
3.2.3.4细菌总DNA提取。将表面消毒的1.0 g植物样品用研钵研磨，加入5 ml无菌水在摇床上200 r/min震荡2 h，离心收集菌体，按高盐法提取植物内生细菌总DNA。用冻融+玻璃珠+溶菌酶+SDS方法提取土壤中细菌总DNA，文献表明获得的DNA最适合于酶解和PCR扩增的要求。
3.2.3.5PCRDGGE分析。对样品基因组DNA的16S rDNA V6V8区片段进行扩增。采用BioRad公司的The DCode Universal Mutation Detection System對PCR样品进行电泳分析。将电泳条带扩增，转化至DH5α大肠杆菌中送测序公司测序，将测序结果用Blast软件与GenBank中得到相关菌株的序列一起输入MEGA4.0和Clustalx1.83程序进行DNA同源性比较和排列，构建系统发育谱系图。
3.2.3.6分离出的微生物筛选及其生物学特性的测定。扩增菌株的16S rRNA序列，送测序公司测序，将测序结果与GenBank中得到的相关菌株的序列进行DNA同源性比较和排列，构建系统发育谱系图。将分离、纯化后的菌株接种到添加了钾长石的BHM培养基中培养，然后采用ICP-AES测定溶液中有效矿质元素含量，并测定菌株的产铁载体能力及其产酸情况。
3.2.4可行性分析。课题组的指导老师长期从事地质微生物学的研究，实验室的学生运用类似的方法进行筛选，测定菌株的生物学特性，并取得了一定的成果，在之前的试验中多次证明微生物对钾长石有风化作用。因此，试验所采用的各项试验方法均已相当成熟，鉴于此，该项目可行，能够达到预期目标。
3.3试验的创新之处项目主要研究小龙山植物内生微生物以及根际土中微生物和非根土微生物的多样性，采用可培养和未可培养结合的方法系统研究植物内生细菌和土壤细菌群落组成，同时研究其在矿物风化中的作用。在之前相关的研究中，大多探讨的是根际土壤和非根际土壤中细菌在矿物风化过程中的作用，鲜见关于自然地质条件下生长的植物内生细菌直接作用于矿物的研究报道，未见海州香薷内生菌作用于钾矿的研究报道。因此，该项目拟开展的研究具有明显的创新性和实用性。
该研究同时采用微生物学、矿物学、现代物理化学和分子生物学等多学科研究技术，体现了交叉学科研究特点。
3.4项目研究计划及预期进展2013年5月～2013年6月， 文献查阅，微生物及相关试验技能训练。2013年6月～2013年10月，样品采集，土壤组分的测定，微生物分离、纯化、保存，菌株分子生物学鉴定以及遗传多样性研究。2013年10月～2014年3月，植物内生菌与土壤微生物生物矿物风化能力试验。2014年3月～2014年4月，筛选有较强分化能力的菌株，初步得到微生物分化机制。2014年4月～2014年5月，论文撰写及提交结题报告。 3.5预期研究成果①筛选出具有较强矿物风化能力的菌株；②探明南京小龙山钾矿中植株内生与土壤细菌群落组成差别；③阐明植物内生与土壤中的细菌对矿物风化的关系；④发表论文1～2篇。
4研究基础
4.1与该项目有关的研究工作积累和已有的研究工作成绩指导老师的课题组长期从事地质微生物学的研究工作，筛选出大量具有矿物风化能力的细菌，采用分子生物学方法结合传统平板分离方法研究了钾矿区超累积植物海州香薷内生及土壤细菌群落多样性，并完成其生物学及生理生化特性测定；实验室具有较好的分子生物学试验基础，对可培养植物内生与土壤微生物的遗传及系统发育多样性有较系统的研究，并研究了植物内生与根际微生物多样性与矿物风化的相互关系，目前已在国内外刊物中发表学术论文多篇。且各种试验方法均已成熟，以上工作积累为项目的开展奠定了良好的基础。
4.2已具备的条件、尚缺少的条件和拟解决的途径该课题直接依托于农业部的农业环境微生物工程重点开放实验室和校教学实验中心，已经拥有从事微生物学、植物生理学和分子生物学方面的一些常规仪器，如高速离心机、各种类型的显微镜、HPLC、紫外扫描仪、气相色谱仪、原子吸收光谱仪、自动定氮仪、细胞压力破碎仪、PCR仪、凝胶成像仪、DGGE仪器等，为项目的完成提供了保证。
5小结
该项目选题为“南京小龙山植物内生与土壤微生物群落差异及其矿物风化能力的研究”，从海州香薷植株中、根际土壤及非根际土壤中结合现代分子生物学方法分离识别出细菌，研究其生理生化特性和群落差异，明确其对矿物分化的能力。项目选题新颖，具有很强的实践创新性；立论依据充分，拟采用的研究方法先进，技术路线和试验方案可行，具有重要的深入研究价值。
参考文献
[1] XIAO B，LIAN B，SUN L L，et al.Gene transcription response to weathering of K-bearing minerals by Aspergillus fumigatus[J].Chemical Geology，2012，306/307：1-9.
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[5] 王静，盛下放，曹建芳，等.南京小龙山钾矿区植物根际可培养细菌的遗传多样性分析[J].微生物学报，2009，49（7）：867-873.
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[19] 王平，李慧，邱译萱，等.荧光假单胞菌株P13分泌分泌铁载体抑制油菜菌核病菌[J].上海师范大学学报，2010，39（2）：200-203.
关键词植物内生菌；土壤细菌；菌落差异；矿物风化；小龙山/南京
中图分类号S181.3文献标识码A文章编号0517-6611（2014）14-04391-03
Study on Colony Differences and Mineral Weathering of Endophytes and Soil Bacterium in Xiaolong Mountain in Nanjing
RUAN Zhepu（College of Life Sciences， Nanjing Agricultural University， Nanjing， Jiangsu 210095）
AbstractElsholtzia splendens， rhizosphere and nonrhizosphere soil in Xiaolong Mountain of Nanjing were selected as materials to get the cultivated bacterium， rhizosphere bacterial and nonrhizosphere bacterium， through study on colony differences， the function and influence of bacterium on plants and soil were analyzed. The cultured bacterium was added into Kfeldspar， the ability of the bacterium in different habitats on mineral weathering was studied， and the strain that has the ability to release mineral elements efficiently was obtained. This study contributes to enrich repository of microorganisms， understand the action and contact between different endophytic bacterium and microbial， and lay the foundation for elucidating the mechanism of mineral weathering bacterium deeply.
Key wordsEndophytes； Soil bacterium； Colony differences； Mineral weathering； Xiaolong Mountain of Nanjing
摘要
该研究从南京小龙山采集海州香薷植株、根际土壤与非根际土壤作为试验材料。从3种材料样品中分离、纯化得到可培养的植物内生细菌、根际细菌与非根际细菌，通过PCRDGGE法研究3种样品之间的细菌群落差异，并由此来分析所得菌种对植株、土壤的作用与影响。将可培养细菌分别加入原位的钾长石中，通过对有效元素、铁载体、总酸度等指标的测定，来分析不同生境细菌对矿物的风化能力以及具有矿物风化能力的细菌类别，探明矿物风化细菌优势菌群，筛选出具有高效释放矿质元素能力的菌株。该研究有助于丰富微生物资源库，了解植物内生细菌与不同土壤微生物的作用与联系，为深入阐明细菌的矿物风化作用机制打下试验基础；对小龙山微生物多样性的调查研究，为保护小龙山-南京的“城市绿肺”的生物多样性提供依据与材料。
2立论依据
生物风化是指矿物、岩石受生物生长及活动影响而发生的风化作用，包括动物、植物和微生物与矿物相互作用等，是在地表发生的最重要的地球化学现象之一[1-4]。在地球表层土壤中，微生物的活动可以导致矿物被破坏，并从矿物中释放出大量植物生长必需的营养物质、金属及非金属元素等提供给植物的生长，而植物生长发育过程中的代谢产物由根部分泌至土壤中，改变了周围土壤的物理和化学性质，使得微生物更易生存，繁殖；并且，这些代谢产物还成为了根系范围内微生物的有效营养物质[5-7]。植物内生菌与土壤细菌群落的种类及差异的研究，不仅有助于了解不同环境下的细菌之间的差异、微生物的生物多样性以及其对生存环境所造成的影响，为研究植物对所处土质的适应性分析以及土壤形成过程中微生物的作用提供有力的依据。
微生物在矿物风化进程中所起的作用不断被认识。Barker等指出，和对照相比，细菌在实验室培养条件下通过产生有机酸和无机酸及胞外聚合物能使Si和Al从斜长石中的溶出量增加两个数量级[8]。Jacob证明以细菌为优势种群的原核微生物群落的丰富度与玄武岩的不同风化程度呈显著正相关关系，最古老的、风化程度最高的玄武岩拥有最高的微生物生物量[9]。矿石表面的微生物能够加速矿物的风化进程，作用机理包括产生有机酸、无机酸、络合金属的配位体，改变氧化还原条件，或者间接产生次生矿物[10-13]。
矿物-微生物相互作用研究，不仅有助于深入了解土壤-微生物作用过程，而且对评估和预测土壤体系中养分元素的有效性也有重要实际意义[14-16]，因此，它已成为当前地质微生物学和土壤学领域的研究热点与前沿。但总体来讲目前这一領域的研究还不系统，许多理论问题还不清楚，关于矿区内植物内生及根际微生物分化矿物的研究鲜见报道。 该研究课题结合国内外对于矿物风化研究的进展，拟研究钾矿区超累积植物海州香薷内生菌、根际土壤与非根际土壤中可培养细菌对矿物的风化能力的强弱（以它们对钾长石的风化效力为标准），以及各样品风化矿物的细菌的主要类群，发现不同来源微生物之间的群落差异，及其与土壤环境的联系，证实不同来源的矿物风化菌群是否存在差异，存在哪些差异；并从中筛选出具有高效风化矿物能力的菌株，作为微生物肥料的候选菌株，也可以为研究矿物风化机理提供试验材料。为保护小龙山-南京的“城市绿肺”的生物多样性提供依据，也为利用微生物改善小龙山废钾矿区的生态环境提供了更多方法。
3研究方案
3.1项目研究的目标、内容和拟解决的关键问题
3.1.1研究目标。研究南京小龙山海州香薷根际土壤与非根际土壤的物理化学性质及植物内生菌及不同土壤中细菌的遗传多样性，筛选出具有明显风化钾长石的菌株，研究其生物学特性以及遗传多样性。从而说明植物内生菌与根际土壤细菌的关系，以及这些细菌对矿物风化、土壤形成的影响。
3.1.2内容。①土壤样品的组分及理化特性；②植物内生菌与根际及非根际土壤微生物的多样性；③筛选具有高效矿物风化能力的菌株，研究其生物学特性。
3.1.3拟解决的关键问题。①根际细菌与非根际细菌的分离、纯化；②植物内生菌、根际与非根际土壤微生物多样性分析；③高效风化能力菌株的筛选。
3.2拟采取的研究方法、技术路线、试验方案及可行性分析
3.2.1研究方法。①不同土壤组成成分分析：将土壤收集2 μm以下粘土矿物做成涂片后进行XRD分析；②海州香薷内生细菌的分离：75%的乙醇消毒后研钵研磨，稀释涂布于YN平板上，置于培养箱培养3 d，对平板上生长的菌落进行纯化后保藏；③土壤样品中细菌的分离：采用稀释涂布法，用YN培养基分离纯化；④细菌的DNA提取、16S rDNA的PCR扩增及其菌株鉴定：参考《分子生物学实验指导》[17]方法提取菌株的总DNA，然后进行PCR扩增，送测序公司进行测序，将测序结果用Blast软件与GenBank数据库进行比对分析；⑤细菌矿物风化能力的测定：物理性质上使用电镜观察钾长石表面的磨损情况，用X射线衍射鉴定矿石成分，化学上参考盛下放等方法（采用ICP-AES测定溶液中有效矿质元素含量等）测定菌株释放矿质元素能力[18]；参考王平等方法测定菌株产铁载体的能力[19]。
3.2.2技术路线。见图1。
图1小龙山钾矿区海州香薷和土壤样品中微生物筛选技术路线3.2.3试验方案。
3.2.3.1不同土壤组成成分分析。取少量土壤悬浊液，测定土壤中的有机质含量，有效态矿质元素含量，尿酶与蔗糖酶的活性及pH。通过XRD测定土壤粘土矿物的组成。
3.2.3.2根际细菌与非根际细菌的分离纯化。用抖根法将根际土壤与非根际土壤分离，抖落的土壤为非根际土壤，附着在根系表面的为根际土壤。用稀释平板法分别分离根际细菌和非根际细菌，挑选单菌落进行划线纯化、保藏。
3.2.3.3植物内生细菌的分离纯化。将采集回的新鲜海州香薷进行表面消毒，放入固体平板中培养24 h，待平板长出菌落，用划线、稀释等分离方法，经过分离、筛选、纯化的反复过程，直至得到纯化的典型菌落。
3.2.3.4细菌总DNA提取。将表面消毒的1.0 g植物样品用研钵研磨，加入5 ml无菌水在摇床上200 r/min震荡2 h，离心收集菌体，按高盐法提取植物内生细菌总DNA。用冻融+玻璃珠+溶菌酶+SDS方法提取土壤中细菌总DNA，文献表明获得的DNA最适合于酶解和PCR扩增的要求。
3.2.3.5PCRDGGE分析。对样品基因组DNA的16S rDNA V6V8区片段进行扩增。采用BioRad公司的The DCode Universal Mutation Detection System對PCR样品进行电泳分析。将电泳条带扩增，转化至DH5α大肠杆菌中送测序公司测序，将测序结果用Blast软件与GenBank中得到相关菌株的序列一起输入MEGA4.0和Clustalx1.83程序进行DNA同源性比较和排列，构建系统发育谱系图。
3.2.3.6分离出的微生物筛选及其生物学特性的测定。扩增菌株的16S rRNA序列，送测序公司测序，将测序结果与GenBank中得到的相关菌株的序列进行DNA同源性比较和排列，构建系统发育谱系图。将分离、纯化后的菌株接种到添加了钾长石的BHM培养基中培养，然后采用ICP-AES测定溶液中有效矿质元素含量，并测定菌株的产铁载体能力及其产酸情况。
3.2.4可行性分析。课题组的指导老师长期从事地质微生物学的研究，实验室的学生运用类似的方法进行筛选，测定菌株的生物学特性，并取得了一定的成果，在之前的试验中多次证明微生物对钾长石有风化作用。因此，试验所采用的各项试验方法均已相当成熟，鉴于此，该项目可行，能够达到预期目标。
3.3试验的创新之处项目主要研究小龙山植物内生微生物以及根际土中微生物和非根土微生物的多样性，采用可培养和未可培养结合的方法系统研究植物内生细菌和土壤细菌群落组成，同时研究其在矿物风化中的作用。在之前相关的研究中，大多探讨的是根际土壤和非根际土壤中细菌在矿物风化过程中的作用，鲜见关于自然地质条件下生长的植物内生细菌直接作用于矿物的研究报道，未见海州香薷内生菌作用于钾矿的研究报道。因此，该项目拟开展的研究具有明显的创新性和实用性。
该研究同时采用微生物学、矿物学、现代物理化学和分子生物学等多学科研究技术，体现了交叉学科研究特点。
3.4项目研究计划及预期进展2013年5月～2013年6月， 文献查阅，微生物及相关试验技能训练。2013年6月～2013年10月，样品采集，土壤组分的测定，微生物分离、纯化、保存，菌株分子生物学鉴定以及遗传多样性研究。2013年10月～2014年3月，植物内生菌与土壤微生物生物矿物风化能力试验。2014年3月～2014年4月，筛选有较强分化能力的菌株，初步得到微生物分化机制。2014年4月～2014年5月，论文撰写及提交结题报告。 3.5预期研究成果①筛选出具有较强矿物风化能力的菌株；②探明南京小龙山钾矿中植株内生与土壤细菌群落组成差别；③阐明植物内生与土壤中的细菌对矿物风化的关系；④发表论文1～2篇。
4研究基础
4.1与该项目有关的研究工作积累和已有的研究工作成绩指导老师的课题组长期从事地质微生物学的研究工作，筛选出大量具有矿物风化能力的细菌，采用分子生物学方法结合传统平板分离方法研究了钾矿区超累积植物海州香薷内生及土壤细菌群落多样性，并完成其生物学及生理生化特性测定；实验室具有较好的分子生物学试验基础，对可培养植物内生与土壤微生物的遗传及系统发育多样性有较系统的研究，并研究了植物内生与根际微生物多样性与矿物风化的相互关系，目前已在国内外刊物中发表学术论文多篇。且各种试验方法均已成熟，以上工作积累为项目的开展奠定了良好的基础。
4.2已具备的条件、尚缺少的条件和拟解决的途径该课题直接依托于农业部的农业环境微生物工程重点开放实验室和校教学实验中心，已经拥有从事微生物学、植物生理学和分子生物学方面的一些常规仪器，如高速离心机、各种类型的显微镜、HPLC、紫外扫描仪、气相色谱仪、原子吸收光谱仪、自动定氮仪、细胞压力破碎仪、PCR仪、凝胶成像仪、DGGE仪器等，为项目的完成提供了保证。
5小结
该项目选题为“南京小龙山植物内生与土壤微生物群落差异及其矿物风化能力的研究”，从海州香薷植株中、根际土壤及非根际土壤中结合现代分子生物学方法分离识别出细菌，研究其生理生化特性和群落差异，明确其对矿物分化的能力。项目选题新颖，具有很强的实践创新性；立论依据充分，拟采用的研究方法先进，技术路线和试验方案可行，具有重要的深入研究价值。
参考文献
[1] XIAO B，LIAN B，SUN L L，et al.Gene transcription response to weathering of K-bearing minerals by Aspergillus fumigatus[J].Chemical Geology，2012，306/307：1-9.
[2] CRUNDWELL F.How do bacteria interact with minerals[J].Hydrometallurgy，2003，71：75-81.
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