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对9种代表性Cry1 A型杀虫晶体蛋白成员进行活性区空间结构的同源模建与比较分析。分析结果表明：Domain Ⅰ和Domain Ⅲ相对保守，其中，Domain Ⅰ整体走向及结构基本重叠，只有 Cry1 Aa和 Cry1 Af多了一个螺旋；DomainⅡ的主要差异体现在loop上；将DomainⅢ结构一致的成员Cry1 Ab，Cry1 Ad，Cry1 Ae和Cry1 Af归为一个亚型，其他5种成员归为另一个亚型。研究确定了影响 Cry1 A型杀虫晶体蛋白结构差异的关键氨基酸及关键结构片段。