微阵列数据的多重比较

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目的 介绍阳性结果错误率(FDR)及相关控制方法在微阵列数据多重比较中的应用。方法 用BH、BL、BY和ALSU四种FDR控制程序比较了3226个基因在两组乳腺癌患者中的表达差异。结果 四个程序在各自实用的范围内均将FDR控制在0.05以下,检验效能由大到小的顺序为:ALSU〉BH〉BY〉BL。ALSU程序因引入m0的估计,更为合理。不仅提高了检验效能,同时又较好地控制了假阳性错误。结论 在微阵列数据的比较中必须考虑FDR的控制,同时又要考虑提高检验效能。多重比较中,控制FDR比控制总Ⅰ型错误率(FWER
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