通过将专利结构根植于创新价值链中,并将金融结构划分为资本市场与信贷市场之间的结构以及中小银行与大银行之间的结构,详细地分析了金融结构对创新的影响.结果 发现:首先,资本市场所占比重的提高,不仅有助于创新投入的增加,而且也会带来高质量创新的增长.尽管高质量创新所需投入更多,科技研发效率相应较低,但是更容易转化为新产品,成果转化效率相应较高.其次,中小银行占银行业的比重也将促进创新投入的增加,但是却更多带来低质量的创新.虽然单位低质量创新所需投入较少,科技研发效率较高,但是更难转化为新产品,成果转化效率较低.最后,从最终的创新成果即新产品产出来看,资本市场占比的提高将显著促进新产品产出的增长,而中小银行占比的影响却并不显著.因此,大力发展资本市场是提高我国高质量自主创新、实现最终创新成果增长的关键.