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宏基因组检测技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)又被称为二代测序或下一代测序技术,是基于高通量测序以及生物信息学分析进行的检测,能直接从环境/临床样品中提取全部微生物的DNA或RNA,并进一步与各个物种的基因组序列比对,准确高效地分析全部病原微生物的遗传物质信息,不仅可以对细菌进行鉴别和分类,还可以检测病毒、真菌和寄生虫等其他病原体。一旦发现病原体的基因组序列,还可实现有关溯源、耐药性、毒力等多种分析[1]。近年来mNGS技术不断发展,在病原检测、