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中医学基于整体观和辨证论治,用整体的、宏观的、系统的方法来把握生命科学。＂方证相关＂体现了方剂与病证之间的内在关系,是中医学辨证论治的核心问题。蛋白质组学是指由一个基因组、一种生物或一种细胞/组织表达的所有蛋白质,具有时空性与整体性,与中医证候的恒动性与整体观念十分贴近。基于蛋白质组学研究虚证与其对应方剂的关系,是探究方证相关性的根本途径之一。