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以岷江百合为材料,对影响ISSR—PCR反应的主要参数进行优化,建立了适用于岷江百合的ISSR—PCR反应体系。20μL反应体系中,内含1×PCR buffer、1.25mmol/L Mg^2+、0L4mmol/LdNTPs、0.6μmol/L、0.5 U Taq DNA聚合酶、20ng模板DNA。扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性40s,52.8℃退火45s,72℃延伸1 min30s,共45个循环;最后72℃延伸8min。该优化系统的建立为今后利用ISSR标记技术开展岷江百合遗传多