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对均一化转录组测序获得的47604个曼氏无针乌贼的微卫星序列进行分析,结果表明,乌贼转录组中微卫星位点丰富,每1402nt的EST中就有一段不小于12nt长度的微卫星序列。单碱基重复是EST微卫星序列的主要形式（38.69%）,其次依次为三碱基（31.14%）、二碱基（26.35%）、四碱基（3.29%）、五碱基（0.38%）、六碱基（0.14%）重复,短序列类型占微卫星总量的96.18%。同碱基类型的微卫星序列组成又存在差异,AC（54.51%）和AG（31.22%）是最常见的二碱基重复序列;而AGC（