烟草黄瓜花叶病毒湖北分离物全基因组序列分析及亚组鉴定

来源 :烟草科技 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hongjiansu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为明确我国湖北烟区烟草黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的亚组类型,对湖北地区侵染烟草的CMV HB24株系进行基因组全长克隆和序列分析。结果表明,HB24株系RNA1(GenBank序列号:KC019299)全长为3363个核苷酸(nt),编码993个氨基酸的1a蛋白;RNA2(GenBank序列号:KC019300)全长为3049nt,编码859个氨基酸的2a蛋白和111个氨基酸的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:KC019301)全长为2216nt,编码279个氨基酸的3a蛋白和218个氨基酸的CP蛋白。核苷酸序列同源性分析表明,HB24与Fny,SD和Q株系RNA1同源性分别为91.6%,91.1%和75.9%,RNA2同源性分别为91.8%,97.8%和69.5%,RNA3同源性分别为92.1%,93.4%和73.2%;与同属花生矮化病毒(Peanut stunt virus,PSV)ER株系RNA1,RNA2和RNA3的同源性分别为65.5%,56.7%和54.1%,与同属番茄不孕病毒(Tomato aspermy virus,TAV)V株系同源性分别为66.9%,57.7%和51.5%。HB24 RNA3 5′NTR(Nontranslated region)的结构分析以及RNA3 5′NTR和CP基因核苷酸序列系统进化树的分析表明,HB24属于CMV亚组IB。 In order to clarify the subtype of tobacco cucumber mosaic virus (CMV) in Hubei tobacco in China, we cloned and sequenced the full-length genomic DNA of CMV HB24 infected with tobacco in Hubei province. The results showed that the full length of HB2 strain RNA1 (GenBank accession number: KC019299) was 3363 nucleotides (nt) and encoded a protein of 993 amino acids. The full length of RNA2 (GenBank accession No: KC019300) was 3049nt and encoded 859 Amino acid 2a protein and 111 amino acid 2b protein; RNA3 (GenBank SEQ ID NO: KC019301) has a total length of 2216nt and encodes a 279 amino acid 3a protein and a 218 amino acid CP protein. Nucleotide sequence homology analysis showed that the homology of RNA1 between HB24 and Fny, SD and Q strains was 91.6%, 91.1% and 75.9%, respectively. The homology of RNA2 was 91.8%, 97.8% and 69.5% The homology was 92.1%, 93.4% and 73.2% respectively. The homologies with RNAi, RNA2 and RNA3 of Peanut stunt virus (PSV) strains were 65.5%, 56.7% and 54.1%, respectively. The homology with the same strain of Tomato aspermy virus (TAV) V was 66.9%, 57.7% and 51.5%, respectively. Structural analysis of the 5’NTR (nontranslated region) of HB24 RNA3 and phylogenetic tree analysis of the 5’NTR and CP gene sequences of RNA3 indicated that HB24 belongs to the CMV subgroup IB.
其他文献
目的:探讨腹腔镜辅助右半结肠癌根治术与传统手术治疗效果差异。方法选取2012年3月~2015年5月我院行治疗右半结肠癌根治术患者61例为研究对象,根据患者手术方式分为腹腔镜组(
目的分析女性房颤患者的临床心理护理干预效果。方法选择我院2014年1月~2015年10月收治的100例女性房颤患者,随机分为对照组和干预组,各50例。对照组予以常规护理,干预组在对
随着我国社会经济的快速发展,人们对环境保护理念的认识不断加深,尤其是对于人口密度越来越大的城市,污水生产量的快速增加,给人们的生活环境带来了较大的影响。针对当前城市
目的:观察以人为本的精细化管理模式在妇产科护理管理中应用的价值。方法选取我院妇产科护理人员30名作为研究对象,于2015年7月~12月实施以人为本的精细化管理模式,观察实施
桐柏山金矿床位于华北地块与杨子地矿的衔接处,地质构造强烈。前人的研究主要集中在岩(矿)的物理化学特征与地质特征,而对与成矿相关的花岗岩锆石Hf同位素特征却鲜有研究。为此,对
14日2月民政部党组传达学习习近平总书记2月12日在中央政治局常委会会议上的重要讲话精神研究部署民政领域疫情防控和复工复产等工作2月14日下午,民政部召开党组会和新冠肺炎
一直以来佛山配电网轻载问题严重,设备利用效率难以有效提升的问题一直困扰着配网的规划与建设。近年来,在着重解决电网重过载等安全风险问题的同时,如何通过实现网络优化合
公立医院补偿机制改革是我国医疗卫生体制改革的重要组成部分,对于保障公共医疗卫生事业的公益性具有关键作用。一般认为,公立医院的补偿渠道主要由医疗服务、药品加成和政府
目的:探讨癌痛的护理方法,分析护理效果。方法将2015年1月~12月收治的癌症患者74例作为研究组对象,实施癌痛规范化护理,另将2014年1月~12月收治,实施常规护理的癌症患者74例
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield