【目的】通过分析不同成盐类型盐湖中的极端嗜盐菌群落组成差异，探究可培养极端嗜盐菌的功能特性。【方法】采集新疆硫酸盐型盐湖七角井和碳酸盐型盐湖南湖的土壤样品，通过平板稀释涂布法分离极端嗜盐菌，经过形态学观察、特征分析获取代表菌株，通过耐盐性测定和16S rRNA基因序列测序等对代表菌株进行鉴定，并对极端嗜盐菌的蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶和酯酶活性进行筛选，同时检测苯酚降解能力。【结果】本研究共获得1 679株极端嗜盐菌，代表菌株45株，隶属于5门14个属，古菌数量（70.58%）明显多于细菌，最优盐浓度生长范围为18.4%–20.0%。在属水平上，盐湖中优势类群为古菌的Haloterrigena属（32.94%）和Natrialba属（26.03%），以及细菌的Aquisalimonas属（9.85%）和Aliifodinibius属（8.10%）。两盐湖中，盐度较低的南湖物种丰富度高于七角井盐湖，古菌物种组成相似，均以Haloterrigena属为主；细菌群落组成有差异，南湖以Aquisalimonas属为主，而七角井以Aliifodinibius属为主。功能筛选表明，盐湖中80%的嗜盐菌功能筛选至少有一种为阳性，产淀粉功能酶菌株占42.58%，多属于Natrialba属。产蛋白酶、纤维素酶和脂肪酶的菌株分别占9.71%、9.29%和7.21%，降解苯酚菌株占11.14%。【结论】本研究揭示了新疆盐湖中可培养极端嗜盐菌的多样性，古菌是优势菌群，细菌种类多样，菌株各类功能酶活性显著，同时，优势的Natrialba、Haloterrigena、Aquisalimonas和Aliifodinibius属菌株均极具应用潜力，可为今后研究应用提供和丰富了菌种资源，具有较大的挖掘潜力。