始于20世纪60年代的中国对非洲医疗援助是体现中国援非成效的又一重大领域。从1963年4月中国向阿尔及利亚派出第一支援非医疗队，到2010年12月，中国共向46个非洲国家派出1.8万人次援外医疗队员，累计治疗患者两亿多人次，并为非洲培训数万名医疗技术人员；有1000多名中国医疗队员分布在41个非洲国家。
　　中国医疗队在自然条件艰苦、任务艰巨、疾病威胁和语言不便等条件下，尽职尽责地履行了职责，为中国援非事业增添了浓重的一笔。
　　1963年中国医务人员在阿尔及利亚工作的塞义达省位于撒哈拉大沙漠边缘，由于条件艰苦，在中国医疗队到来之前，西方国家的医生已经纷纷撤离。面对当地气候和生活的恶劣条件，中国医疗队不畏艰苦，在开展正常治疗的同时，还经常深入到偏远的沙漠地区巡诊和医治病人。更严峻的挑战是中国医生工作时常常面临着被传染疾病的巨大风险。在血吸虫病肆虐的乌干达，中国医疗队在难以获得清洁饮用水的情况下，曾不得不到两公里外的尼罗河打水，随时面临感染血吸虫病的危险。许多中国医疗队员遭受蚊虫叮咬或通过其他渠道感染疟疾，有的多次受到传染。
　　艾滋病是非洲人面临的可怕杀手。在艾滋病高发的莫桑比克马普托中心医院工作的中国医疗队员也经历了生死考验。在这里接受手术治疗的患者中，艾滋病患者和艾滋病毒感染者比例很高，手术中被医疗器械和病人骨头端刺伤的中国医生随时面临被感染的风险。周维良医生就是典型的例子。在一次手术进行到最后的缝针阶段时，他的手正好碰上了助手手中的针头。手术结束后，经过血检，他被确定为艾滋病病毒携带者。博茨瓦纳的仰加奎医院是艾滋病人最密集的地方，90％以上的病人都是艾滋病患者或病毒携带者。在这里工作的中国外科医生绝大多数都曾被医疗器械刺伤过，有的甚至被刺伤多次。同时，由于艾滋病患者身体免疫力急剧下降，常有结核病等并发症，这对医护人员的健康形成了新的威胁。在1963年到2003年中，有43名中国医疗队员为医疗援非献出了生命。
　　中国医疗队在非洲创造了多例医疗奇迹。1984年，中国医疗队在利比亚的黎波里医院成功实施了该国第一例断肢再植手术；1990年在贝宁成功实施该国第一例开颅术；中国的传统医药、针灸、按摩以及中西医结合的诊疗办法在非洲国家取得良好效果，40多年里在非洲治愈了数万病人，成功地治疗了包括偏瘫失语症等在内的一些疑难顽症。在坦桑尼亚，中国医疗队仅在2006年就共计诊治七万余名患者，施行近四千台手术，抢救一千余名危重病人，并积极开展新项目，成功实施了不少有影响的疑难手术。
　　中国医疗队员精湛的技术水平和敬业精神，受到非洲人民的高度赞扬。在中国医疗队工作过的非洲国家，几乎都经历过中国医疗队即将离去时，当地人民依依不舍、含泪相送的场景。40余年中，中国医疗队得到“白衣天使”、“南南合作的范例”和“最受欢迎的人”等多种赞誉。到2003年底，共有610名中国医疗队员被非洲国家领导人授予“骑士勋章”或“总统勋章”。