Genetic analysis and fine mapping of a lax mutant in rice

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We have analyzed a lax mutant that exhibits altered panicle architecture in rice. The primary and secondary rachis-branches are normally initiated and each branch ends in a terminal spikelet, but all the lateral spikelets are absent and the terminal spikelet displays variegated structures in the mutant. An F2 population from the cross between thelax mutant and a japonica variety, Wll, was constructed and analyzed. Using microsatellite and CAPS markers, the lax locus was mapped on the long arm of chromosome 1,co-segregated with a CAPS marker, LZ1, within an interval of 0.28 cM between a CAPS marker, HB2, and a microsatellite marker, MRG4389. RT-PCR analysis revealed that the expressions of the rice B-function MADS-box genes OsMADS2, OsMADS4, OsMADS16 and OsMADS3 were significantly reduced, whereas the expression of the rice A-function ene RAP1A was not altered.
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