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期刊论文
离散蛙跳算法预测RNA二级结构
离散蛙跳算法预测RNA二级结构
来源 :南京师范大学学报:工程技术版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ltsomeday
【摘 要】
:
针对RNA二级结构预测问题,提出了一种离散蛙跳算法,根据RNA分子折叠的特点,重新定义个体的移动距离和位置,并借鉴粒子群优化算法中的惯性权重加以改进,使算法在空间探索和局
【作 者】
:
林娟
钟一文
张骏
【机 构】
:
福建农林大学计算机与信息学院
【出 处】
:
南京师范大学学报:工程技术版
【发表日期】
:
2011年4期
【关键词】
:
RNA二级结构预测
离散蛙跳算法
最小自由能
茎区组合优化
RNA secondary structure prediction
discrete shuff
【基金项目】
:
福建省自然科学基金项目(2008J0316), 福建农林大学青年教师科研基金(2010018)
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针对RNA二级结构预测问题,提出了一种离散蛙跳算法,根据RNA分子折叠的特点,重新定义个体的移动距离和位置,并借鉴粒子群优化算法中的惯性权重加以改进,使算法在空间探索和局部求精间取得了很好的平衡.与同领域中著名的预测软件进行了仿真比较,结果表明新的算法具有较高的预测精度.
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