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土屋特大型斑岩铜矿位于东天山吐鲁番－哈密陆块南部边缘岛弧环境中。多期岩浆活动和矿化是铜金属超常堆集的主要因素。海底火山活动和热泉沸腾逸散造就了铜金属的预富集（矿源层），闪长玢岩和斜长花岗斑岩的侵位和叠加矿化使铜金属进一步富化和最终成矿，以细碧角斑质为主的火山岩喷发于潮坪－滨海环境，闪长玢岩、斜长花岗斑岩形成于较强的氧化环境；强还原示踪矿物黄铁矿含量较少。矿石的低品位、矿石的结构构造、蚀变特征以及矿石建造具典型斑岩矿床特征；矿石高品位、矿床形成较低温度及大量硅化蚀变又表现为某些热液矿床特征（次火山岩热液）。